男性感染滴虫病，可能是因为女性患有滴虫性阴道炎，在进行性生活时或者间接接触的情况下，发生的交叉感染。一旦感染滴虫病，是不能够自愈的，需要进行药物治疗。首选的治疗药物是甲硝唑，口服甲硝唑片，一天三次，一次一片，局部使用高锰酸钾溶液清洗。
滴虫病具有很强的传染性，所以男女之间一定要做好交叉隔离措施，而且要男女双方一起治疗，否则反复发生交叉感染。
男人有滴虫，建议应该将会阴部的阴毛完全剃除，然后用肥皂水对会阴部进行有效的清洗，一般建议就是用普通的肥皂，或者硫磺软皂，清洗效果更好。同时应该多喝水，应该吃甲硝唑，甲硝唑推荐每次吃0.5g，每天一次口服，连续治疗5-7天。
有可能通过性交导致女性也出现感染，男性如果有滴虫感染，女性也应该同时检查、同时治疗，避免反复出现交叉感染。
由于滴虫常感染男性尿道和尿道周围腺体，局部用药难以在尿道或尿道周围腺体达到有效的治疗目的，因此系统用药优于局部给药，系统用药方案可以选择甲硝唑，治疗期间及治疗后48小时应避免饮酒，同时避免性行为。
近年来甲硝唑治疗失败的病例时有报道，治疗失败的常见原因有未遵医嘱用药、再感染或耐药。有报道对甲硝唑耐药或不能耐受的患者用替硝唑治疗，可获得良好效果。
