男性不育患者去医院做检查首先就要做精液常规检查，这是测定男性生育力最基本、最重要的临床指标，有关精液的参数是医师最先需要了解的，患者要注意的是：3—5天不同房再去检查;最好用手淫方法取标本;要能保证获得全部精液;2周内复查1—2次。
前列腺液检查也是诊断男性不育的常见检查项目。在正常情况下，前列腺液应为乳白色、偏碱性，高倍镜下可明显见到满视野微小且可折光的卵磷脂颗粒，并具有精子以及少许的上皮细胞和淀粉样物质。当有炎症等病症发生后，前列腺液中就会明显发现大量增多的白细胞以及成堆的脓细胞，卵磷脂颗粒会显著减少。
男性不育也有可能是染色体和基因方面的异常所导致的，所以遗传方面也需要做个检查，对现有性别分化异常或身体有其他遗传缺陷、无精症和严重少精症、有遗传病家族史、习惯性流产夫妇做染色体及基因检查，有着十分重要意义。
内分泌异常也有可能会导致男性生殖功能出现问题，内分泌检查主要是有关性激素T、FSH、LH、PRL、E2的测定和各种激发试验，如HCG刺激试验等。
微生物检查
除了以上原因之外，造成男性不育的还有一个重要原因就是男性的泌尿生殖感染疾病，因此男性不育患者需做与男性泌尿、生殖系统感染有关的病原微生物有细菌、病毒、螺旋体、支原体、衣原体等微生物检查。
