因为人工授精前要促排卵治疗，所以可能发生卵巢过度刺激综合征。轻者出现轻度腹胀，有的出现恶心、呕吐、腹泻等消化道症状。甚者自觉腹胀、腹痛。重者出现血液浓缩、高凝状态、电解质紊乱、肝肾功能损害等，甚至危及生命。
授精的时间选择有一定的局限性，你丈夫必须能够在医院里的取精室通过手淫的方式将精液放入专用的杯子中。如果插入人工授精导管有困难，人工授精也会让一些女性感到不舒服。同时，人工授精还可能会引起类似痛经的痉挛性疼痛。
因为要用细管将优化的精液打入子宫，会增加子宫及输卵管感染的机会。操作时会带入细菌，处理精液时也可能导致细菌污染。
对于这个问题，专家说，多因宫腔插管困难或操作粗暴所致，所以首先选择软硬适度的授精管，操作者做到轻、稳、准，避免损伤宫颈管及子宫内膜造成出血，以免影响授精效果。
会出现异常的妊娠结局
人工授精的多胎妊娠发生率可达20%，宫外孕约2%-8%，自然流产率为20% -30%。
如果供精者有传染病，可能会传给受精者。潜在的医学伦理学、遗传学危险在AID中，当一份供精者的精液为两名以上妇女授精后，这些妇女所生的子女从血缘关系上将属于同父异母的兄弟姐妹。由于A1D的保密性，这些同父异母的子代是不能也无法相互认识的。他们成年后万一恰巧成婚，即将造成血缘婚姻，可能会产生对子代的遗传性危害。尽管这种巧合发生的机会很少。
夫妇间新鲜精液人工授精时多因精液注入速度过快、压力过多以致发生子宫痉挛性收缩而疼痛。若做子宫腔内授精，如注入的精液过多，精液可经输卵管流入腹腔，引起刺激性下腹痛，诱发下腹痉挛性疼痛。
性交方式的改变对心理有一定的影响，人工授精本身造成的紧张与迫切妊娠心理对排卵活动的规律性也会有一定的影响。
