蛋壳表面出现肉眼可见的褐色斑点，有的斑点甚至稍微凸起，被称为“雀斑蛋”，是因钙和蛋壳色素分布不均匀而形成的。
由于蛋壳颜色与鸡蛋内物质形成的阶段各不相同，因此这类“长斑蛋”与细菌污染并无联系，可以食用。
鸡蛋蛋壳底部有一种色泽较暗的水印状斑点或者条带，看上去也比一般的鸡蛋颜色稍暗，叫做“暗斑蛋”或“底斑蛋”。
“暗斑蛋”是鸡蛋壳内的水分透过韧性较差的蛋壳膜并积聚在蛋壳附近造成的，也与沙门氏菌污染没有关系，可以吃。
蛋壳上有很多气孔，若存放时间过长，细菌、霉菌等微生物有可能会钻孔而入，扩散到一定程度时，蛋壳表面就会形成斑块;若斑块较大，蛋白可能已经被感染。
这样的鸡蛋虽然和沙门氏菌没有必然关系，但并不安全，不建议食用。
