发生率1%~2%，可损害心脏瓣膜，是布鲁氏菌病最严重的并发症之一，也是布鲁氏菌病患者死亡的主要原因。
表现为关节肿痛和僵硬，膝关节、股关节、踝关节、腕关节和脊柱关节最常受累，其中脊柱炎治疗难度较大，炎症持续存在可影响脊柱功能。
布鲁氏菌侵入男性生殖系统后，可导致附睾睾丸炎，主要症状表现为睾丸肿痛，这在男性患者中并不少见，，多为单侧。
2%~7%的布鲁氏菌病会发生神经系统受累，表现为急慢性脑膜炎、脑膜脑炎、脊髓炎或多发性神经根神经病。布鲁氏菌病引起的脑膜炎与结核性脑膜炎的脑脊液表现类似，脑脊液病原学检查可协助证实。
布鲁氏菌病可造成多种皮肤损害，包括皮疹、结节、丘疹、结节性红斑、瘀点、紫癜。皮肤溃疡、脓肿、化脓性淋巴管炎则常出现于猪种布鲁氏菌感染。偶尔出现鼻出血、牙龈出血、血尿、皮肤紫癜，这是由于脾功能亢进、骨髓吞噬作用和(或)抗血小板抗体导致血小板急剧减少。
其他少见的全身并发症还包括肝炎、肺炎、胸膜炎、皮疹、葡萄膜炎等。
