因豆浆偏寒，所以消化不良、肠胃功能不好的人尽量少喝豆浆。而且豆浆在酶的作用下能产气，所以腹胀、腹泻的人最好少喝豆浆。
此外，手术或生病后的病人身体抵抗力普遍较弱，肠胃功能也不好，因此，在恢復期间最好少饮用寒性的豆浆，这样容易产生噁心、腹泻等症状。
因为豆浆在人体内的代谢过程当中，会在细胞内产生核酸、尿酸，所以罹患高尿酸血症的病人不宜喝豆浆。至于肾功能不佳、或者是肾衰竭洗肾者，饮用豆浆的量每天不宜超过200cc，以免造成磷和钾的摄入取超标。
豆浆最好不要与红霉素等抗生素一起服用，因为二者会发生化学反应，喝豆浆与服用抗生素的间隔时间最好在1个小时以上。
一岁半以内的婴儿页不宜喝豆浆，因为婴幼儿肠胃功能尚未发育完全，胃内还没有分解豆类的消化酶，同时豆浆也容易增加婴儿腹胀的情况，因此年龄较小的婴儿不宜喝豆浆。
