1、人工牛黄甲硝唑胶囊最严重不良反应为高剂量时可引起癫痫发作和周围神经病变，后者主要表现为肢端麻木和感觉异常。某些病例长期用药时可产生持续性周围神经病变。
2、动物试验或体外测定发现 人工牛黄甲硝唑胶囊具致癌、致突变作用。但人体中尚未证实。
3、其他常见的不良反应有：
(1)胃肠道反应，如恶心、食欲减退、呕吐、腹泻、腹部不适、味觉改变、口干、口腔金属味等。
(2)可逆性粒细胞减少。
(3)过敏反应，皮疹、荨麻疹、瘙痒等。
(4)中枢神经系统症状，如头痛、眩晕、晕厥、感觉异常、肢体麻木、共济失调和精神错乱等。
(5)其他有发热、阴道念珠菌感染、膀胱炎、排尿困难、尿液颜色发黑等，均属可逆性，停药后自行恢复。
人工牛黄甲硝唑胶囊用药注意事项
1、用药期间不应饮用含酒精的饮料，因可引起体内乙醛蓄积，干扰酒精的氧化作用过程、导致双硫仑样反应，患者可出现腹部痉挛，恶心，呕吐，头痛、面部潮红等。
2、 肝功能减退者本品代谢减慢，药物及其代物易在体内蓄积，应减量使用。并作血药浓度监测。
3、 本品可自胃液持续清除，某些放置胃管作吸引减压者，可引起血药浓度下降。血液透析时，本品及代谢物迅速被清除，故本品不需减量。
4、念珠菌感染者应用本品，其症状会加重。需同时给抗真菌治疗。
5、厌氧菌感染合并肾功能衰竭患者，给药间隔时间应由8小时延长至12小时。
6、治疗阴道滴虫病时，需同时治疗其性伴侣。
7、儿童应慎用并减量使用。
8、甲硝唑可透过胎盘，迅速进入胎儿循环。动物试验发现口服给药对胎仔无毒性。甲硝唑对胎儿的影响尚无足够和严密的对照观察，因此孕妇禁用。
9、甲硝唑在乳汁中浓度与血中相似。动物试验显示本品对幼鼠具致癌作用，故哺乳期妇女不宜使用。若必须用药，应中断授乳，并在疗程结束后24～48小时方可重新授乳。
7、重复一个疗程前，应做白细胞计数。
